生物信息学
生物信息学是一门发展潜力巨大的交叉学科。本课程适用于生命科学、农学、医学、信息科学等相关专业本科、硕士、博士各阶段的同学,以及生物医学领域的科研工作者。课程涵盖生物信息学领域的几乎所有内容,包括数据库、序列分析、蛋白质结构、组学、算法、统计、数据挖掘、编程等,真的很有用哦~,亲!
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课程目录
第二章:生物数据库(第一部分)
2.1 为什么需要生物数据库
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2.2 生物数据库的分类
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2.3 文献数据库:PubMed
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2.3 文献数据库:PubMed
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2.4 一级核酸数据库:GeneBank
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2.4 一级核酸数据库:GeneBank
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2.4 一级核酸数据库:GeneBank
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2.4 一级核酸数据库:GeneBank
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2.5 一级核酸数据库:基因组数据库
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2.5 一级核酸数据库:基因组数据库
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2.6 二级核酸数据库
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第二章:生物数据库(第二部分)
2.7 一级蛋白质序列数据库:UniProtKB
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2.7 一级蛋白质序列数据库:UniProtKB
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2.7 一级蛋白质序列数据库:UniProtKB
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2.8 一级蛋白质结构数据库:PDB
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2.8 一级蛋白质结构数据库:PDB
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2.8 一级蛋白质结构数据库:PDB
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2.9 二级蛋白质数据库:Pfam,CATH,SCOP2
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2.9 二级蛋白质数据库:Pfam,CATH,SCOP2
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2.9 二级蛋白质数据库:Pfam,CATH,SCOP2
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2.10 专用数据库:KEGG,OMIM
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2.10 专用数据库:KEGG,OMIM
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第三章:序列比较(第一部分)
3.1 认识序列
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3.2 序列相似性
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3.3 替换记分矩阵
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3.3 替换记分矩阵
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3.3 替换记分矩阵
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3.4 序列两两比较:打点法
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3.4 序列两两比较:打点法
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3.4 序列两两比较:打点法
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3.5 序列两两比较:序列比对法
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3.5 序列两两比较:序列比对法
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3.5 序列两两比较:序列比对法
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3.6 一致度和相似度
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第三章:序列比较(第二部分)
3.7 在线双序列比对工具
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3.7 在线双序列比对工具
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3.7 在线双序列比对工具
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3.7 在线双序列比对工具
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3.8 BLAST搜索
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3.8 BLAST搜索
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3.8 BLAST搜索
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3.8 BLAST搜索
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3.8 BLAST搜索
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3.8 BLAST搜索
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第三章:序列比较(第三部分)
多序列比对介绍
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多序列比对介绍
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在线多序列比对工具
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在线多序列比对工具
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在线多序列比对工具
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多序列比对的编辑和发布
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多序列比对的编辑和发布
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寻找保守区域
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寻找保守区域
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寻找保守区域
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第四章:分子进化与系统发生
进化的故事
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进化的故事
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基本概念
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基本概念
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基本概念
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系统发生树
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系统发生树
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系统发生树的构建
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MEGA7构建NJ树
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MEGA7构建NJ树
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课后甜品
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课后甜品
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第五章:蛋白质结构预测与分析(第一部分)
蛋白质的结构
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蛋白质的二级结构
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蛋白质的二级结构
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蛋白质的二级结构
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蛋白质的三级结构
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三级结构可视化软件VMD
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三级结构可视化软件VMD
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三级结构可视化软件VMD
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三级结构可视化软件VMD
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第五章:蛋白质结构预测与分析(第二部分)
计算方法预测三级结构
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计算方法预测三级结构
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计算方法预测三级结构
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计算方法预测三级结构
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计算方法预测三级结构
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计算方法预测三级结构
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三级结构的比对
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三级结构的比对
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蛋白质分子表面性质
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蛋白质分子表面性质
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第五章:蛋白质结构预测与分析(第三部分)
获取蛋白质四级结构
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蛋白质-蛋白质分子对接
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蛋白质-蛋白质分子对接
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蛋白质-小分子分子对接
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蛋白质-小分子分子对接
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蛋白质-小分子分子对接
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虚拟筛选与反向对接
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虚拟筛选与反向对接
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虚拟筛选与反向对接
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分子动力学模拟
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第六章:高通量测序技术及应用
基因组学与测序技术
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高通量测序技术在精准医学中的应用
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生物信息学面临的挑战
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生物信息学面临的挑战
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生物信息学面临的挑战
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从头测序
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重测序
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转录组测序
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表观基因组学
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猛犸象基因组测序计划
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古基因组学面临的挑战
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古基因组学研究中的生物信息技术
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第七章:统计基础与序列算法
贝叶斯公式及其生物学应用
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贝叶斯公式及其生物学应用
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贝叶斯公式及其生物学应用
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二元预测的灵敏度和特异度
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二元预测的灵敏度和特异度
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二元预测的灵敏度和特异度
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基本序列算法
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基本序列算法
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基本序列算法
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第八章:数据挖掘
什么是数据挖掘
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什么是数据挖掘
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什么是数据挖掘
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数据库系统
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机器学习
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机器学习
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机器学习
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WEKA
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WEKA
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WEKA
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WEKA
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WEKA
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第九章:编程基础与网页制作(第一部分)
Linux操作系统
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Linux基本命令
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Linux基本命令
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Perl语言基础入门
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Perl语言基础入门
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Perl语言基础入门
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Perl语言基础入门
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Perl语言基础高级
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Perl语言基础高级
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第九章:编程基础与网页制作(第二部分)
前端开发和HTML介绍
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HTML常用标签
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HTML常用标签
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设计简单的网页
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设计简单的网页
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设计简单的网页
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设计简单的网页
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HTML与CGI简单交互
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