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生物大数据 福建农林大学
- 内容简介:
- 本课程在福建农林大学课程教学团队的基础上，邀请来自香港大学、浙江大学、山东农业大学等国内高校的专家学者，整合资源，根据每个专家学者的科学研究特长，合理规划和建设课程讲授章节，构建“大数据时代的生物信息学”的系列课程内容。
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课程介绍
| 第一章 绪论 | 第一节 大数据的特征与价值 | 第一小节 大数据的概念 |
| 第一章 绪论 | 第一节 大数据的特征与价值 | 第二小节 大数据的特征 |
| 第一章 绪论 | 第一节 大数据的特征与价值 | 第三小节 大数据的应用 |
| 第一章 绪论 | 第一节 大数据的特征与价值 | 第四小节 人类面临的挑战 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第一节 基因组测序技术 | 2.1.1 一代测序技术的原理 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第一节 基因组测序技术 | 2.1.2 一代测序技术的优缺点 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第一节 基因组测序技术 | 2.1.3 二代测序技术的原理 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第一节 基因组测序技术 | 2.1.4 二代测序技术的优缺点 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第一节 基因组测序技术 | 2.1.5 三代测序技术的原理 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第一节 基因组测序技术 | 2.1.6 三代测序技术的优缺点及三代技术的比较 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第二节 基因组测序方式与质量控制 | 2.2.1 3种测序方式简介 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第二节 基因组测序方式与质量控制 | 2.2.2 Mate Pair建库方式及比较 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第二节 基因组测序方式与质量控制 | 2.2.3 单端和双端测序 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第二节 基因组测序方式与质量控制 | 2.2.4 测序结果的存储格式 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第二节 基因组测序方式与质量控制 | 2.2.5 基因组测序数据的质量控制 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第三节 基因组测序的组装技术 | 2.3.1 从头组装及常用工具 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第三节 基因组测序的组装技术 | 2.3.2 从头组装常用工具比较 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第三节 基因组测序的组装技术 | 2.3.3 不同建库方式在从头测序中的意义 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第三节 基因组测序的组装技术 | 2.3.4 从头测序组装流程及评估 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第三节 基因组测序的组装技术 | 2.3.5 从头测序组装效果评价 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第四节 转录组测序与分析 | 2.4.1 转录组与大数据简介 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第四节 转录组测序与分析 | 2.4.2 C值悖论 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第四节 转录组测序与分析 | 2.4.3 RNA的种类与简介 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第四节 转录组测序与分析 | 2.4.4 RNA-Seq原理与应用 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第四节 转录组测序与分析 | 2.4.5 RNA-Seq应用案例介绍 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第五节 宏基因组测序与分析 | 2.5.1 宏基因组简介 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第五节 宏基因组测序与分析 | 2.5.2 Ted上关于肠道微生物重要性的介绍 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第五节 宏基因组测序与分析 | 2.5.3 菌群多样性分析流程 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第五节 宏基因组测序与分析 | 2.5.4 宏基因组研究的意义 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第五节 宏基因组测序与分析 | 2.5.5 宏基因组报告解读 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第五节 宏基因组测序与分析 | 2.5.6 宏基因组测序实例 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第五节 宏基因组测序与分析 | 2.5.7 宏基因组重测序 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第六节 基因组测序技术的应用：来自华大的案例 | 2.6.1 华大基因之动植物研究 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第六节 基因组测序技术的应用：来自华大的案例 | 2.6.2 华大小米研究案例 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第六节 基因组测序技术的应用：来自华大的案例 | 2.6.3 测序技术在食品检测中的应用 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第六节 基因组测序技术的应用：来自华大的案例 | 2.6.4 测序技术在警犬筛选中的应用 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第六节 基因组测序技术的应用：来自华大的案例 | 2.6.5 基因组从头测序及应用 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第六节 基因组测序技术的应用：来自华大的案例 | 2.6.6 全基因组测序技术及应用 |
| 第二章 基因组测序技术 | 第六节 基因组测序技术的应用：来自华大的案例 | 2.6.7 测序技术在基因分型中的应用 |
| 第三章 核酸数据库 | 第一节 DNA序列数据库 | 3.1.1 DNA序列数据库 |
| 第三章 核酸数据库 | 第一节 DNA序列数据库 | 3.1.2 GenBank概览 |
| 第三章 核酸数据库 | 第二节 NCBI数据库检索策略 | 3.2.1 NCBI检索策略 |
| 第三章 核酸数据库 | 第二节 NCBI数据库检索策略 | 3.2.2 NCBI高级检索 |
| 第四章 蛋白质数据库 | 第一节 蛋白质数据库概览 | 4.1 蛋白质数据库概览 |
| 第四章 蛋白质数据库 | 第二节 蛋白质序列数据库 | 4.2 蛋白质序列数据库 |
| 第四章 蛋白质数据库 | 第三节 蛋白质模式和域的数据库 | 4.3 蛋白质模式和域的数据库 |
| 第四章 蛋白质数据库 | 第四节 蛋白质结构数据库 | 4.4 蛋白质结构数据库 |
| 第四章 蛋白质数据库 | 第五节 蛋白质分类数据库 | 4.5 蛋白质分类数据库 |
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