生物大数据 福建农林大学

内容简介:
本课程在福建农林大学课程教学团队的基础上,邀请来自香港大学、浙江大学、山东农业大学等国内高校的专家学者,整合资源,根据每个专家学者的科学研究特长,合理规划和建设课程讲授章节,构建“大数据时代的生物信息学”的系列课程内容。
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课程介绍
第一章 绪论 第一节 大数据的特征与价值 第一小节 大数据的概念
第一章 绪论 第一节 大数据的特征与价值 第二小节 大数据的特征
第一章 绪论 第一节 大数据的特征与价值 第三小节 大数据的应用
第一章 绪论 第一节 大数据的特征与价值 第四小节 人类面临的挑战
第二章 基因组测序技术 第一节 基因组测序技术 2.1.1 一代测序技术的原理
第二章 基因组测序技术 第一节 基因组测序技术 2.1.2 一代测序技术的优缺点
第二章 基因组测序技术 第一节 基因组测序技术 2.1.3 二代测序技术的原理
第二章 基因组测序技术 第一节 基因组测序技术 2.1.4 二代测序技术的优缺点
第二章 基因组测序技术 第一节 基因组测序技术 2.1.5 三代测序技术的原理
第二章 基因组测序技术 第一节 基因组测序技术 2.1.6 三代测序技术的优缺点及三代技术的比较
第二章 基因组测序技术 第二节 基因组测序方式与质量控制 2.2.1 3种测序方式简介
第二章 基因组测序技术 第二节 基因组测序方式与质量控制 2.2.2 Mate Pair建库方式及比较
第二章 基因组测序技术 第二节 基因组测序方式与质量控制 2.2.3 单端和双端测序
第二章 基因组测序技术 第二节 基因组测序方式与质量控制 2.2.4 测序结果的存储格式
第二章 基因组测序技术 第二节 基因组测序方式与质量控制 2.2.5 基因组测序数据的质量控制
第二章 基因组测序技术 第三节 基因组测序的组装技术 2.3.1 从头组装及常用工具
第二章 基因组测序技术 第三节 基因组测序的组装技术 2.3.2 从头组装常用工具比较
第二章 基因组测序技术 第三节 基因组测序的组装技术 2.3.3 不同建库方式在从头测序中的意义
第二章 基因组测序技术 第三节 基因组测序的组装技术 2.3.4 从头测序组装流程及评估
第二章 基因组测序技术 第三节 基因组测序的组装技术 2.3.5 从头测序组装效果评价
第二章 基因组测序技术 第四节 转录组测序与分析 2.4.1 转录组与大数据简介
第二章 基因组测序技术 第四节 转录组测序与分析 2.4.2 C值悖论
第二章 基因组测序技术 第四节 转录组测序与分析 2.4.3 RNA的种类与简介
第二章 基因组测序技术 第四节 转录组测序与分析 2.4.4 RNA-Seq原理与应用
第二章 基因组测序技术 第四节 转录组测序与分析 2.4.5 RNA-Seq应用案例介绍
第二章 基因组测序技术 第五节 宏基因组测序与分析 2.5.1 宏基因组简介
第二章 基因组测序技术 第五节 宏基因组测序与分析 2.5.2 Ted上关于肠道微生物重要性的介绍
第二章 基因组测序技术 第五节 宏基因组测序与分析 2.5.3 菌群多样性分析流程
第二章 基因组测序技术 第五节 宏基因组测序与分析 2.5.4 宏基因组研究的意义
第二章 基因组测序技术 第五节 宏基因组测序与分析 2.5.5 宏基因组报告解读
第二章 基因组测序技术 第五节 宏基因组测序与分析 2.5.6 宏基因组测序实例
第二章 基因组测序技术 第五节 宏基因组测序与分析 2.5.7 宏基因组重测序
第二章 基因组测序技术 第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例 2.6.1 华大基因之动植物研究
第二章 基因组测序技术 第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例 2.6.2 华大小米研究案例
第二章 基因组测序技术 第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例 2.6.3 测序技术在食品检测中的应用
第二章 基因组测序技术 第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例 2.6.4 测序技术在警犬筛选中的应用
第二章 基因组测序技术 第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例 2.6.5 基因组从头测序及应用
第二章 基因组测序技术 第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例 2.6.6 全基因组测序技术及应用
第二章 基因组测序技术 第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例 2.6.7 测序技术在基因分型中的应用
第三章 核酸数据库 第一节 DNA序列数据库 3.1.1 DNA序列数据库
第三章 核酸数据库 第一节 DNA序列数据库 3.1.2 GenBank概览
第三章 核酸数据库 第二节 NCBI数据库检索策略 3.2.1 NCBI检索策略
第三章 核酸数据库 第二节 NCBI数据库检索策略 3.2.2 NCBI高级检索
第四章 蛋白质数据库 第一节 蛋白质数据库概览 4.1 蛋白质数据库概览
第四章 蛋白质数据库 第二节 蛋白质序列数据库 4.2 蛋白质序列数据库
第四章 蛋白质数据库 第三节 蛋白质模式和域的数据库 4.3 蛋白质模式和域的数据库
第四章 蛋白质数据库 第四节 蛋白质结构数据库 4.4 蛋白质结构数据库
第四章 蛋白质数据库 第五节 蛋白质分类数据库 4.5 蛋白质分类数据库
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